Porvair Sciences发表了一份应用案例说明,阐述了 Chromatrap 的新型 96 孔染色质免疫沉淀反应 (ChIP) 测定技术。
现代表观遗传学领域科技发展迅速,所有指导原则都是通过活体内蛋白质与 DNA 的动态绑定来调节基因,研究人员阐述道。其关键在于需要分析大量的高含量和低含量调节机制,来系统性地描绘出接触病原体后蛋白质与 DNA 的交互反应。

染色质免疫沉淀反应 (ChIP) 测定通常用于研究这两者之间的关联,一直以来均局限于大量的样品研究,费力的清洗步骤导致大量样品丢失,噪声比较低,而且再现性差。
新型应用案例说明中详细阐述了 Chromatrap®96 Pro-A(一种 96 孔微孔板)的使用,所有孔都含有固相的固态多孔聚合物 BioVyonTM(其中通过化学反应绑定蛋白质 A),因此 96 ChIP 测定法可在同一个孔板上同时运行。
为确定在筛选表观遗传靶点时 Chromatrap®96 是否易于使用、是否具有高度的设计灵活性以及高度的再现性,我们必须在 96 孔板上对三个人体染色质样品(HepG2、HeLa 和 K562)的三个基因靶点(GAPDH、beta-globin 和 PABPC1)同时开展常规表观遗传标记(H3、H4、H3K4me3 和 RNA pol II)的绑定效率和占用率研究,并使用 qPCR 进行分析。应用案例说明中详述了分析法、数据解读以及统计分析法,以及使用新型 Chromatrap®96 高通量 ChIP 测定板的好处。该测定板具备多向性靶点筛选功能、灵活的实验设计、可靠的再现性、高数据指令以及全自动移液功能。