用于qPCR和测序的最佳ChIP酶剪切/超声剪切方法 
    Porvair Sciences公司Chromatrap®产品事业部发布了运用其专利固相染色质免疫沉淀(ChIP)技术开发的实验方法。
 
    这为科学家提供了最佳的ChIP实验方法,涵盖qPCR 、高通量qPCR 、测序和高通量测序和使用Chromatrap® 试剂盒进行染色质酶剪切。
 

 
    Chromatrap®是一项能够使ChIP反应变得更快速、更简单、更有效的突破性技术。qPCR分析所用的Chromatrap®试剂盒采用革命性的 Chromatrap®蛋白质-A 或蛋白质-G完成共价连接的圆盘状惰性多孔聚合物捕获目标染色质/抗体复合物,大大提高了捕获效率。反应期间,所述染色质/抗体复合物由盘(disc)保持。只需三个缓冲液和一步洗脱步骤冲洗即能得到目标DNA片段。操作中不需要使用磁珠琼脂糖珠,消除了非特异性背景并大大减少人工操作误差和样品损失。优化的洗脱缓冲液允许样品直接在qPCR中分析,而不需要进行DNA纯化,从而进一步降低样品损失。
 
 
Chromatrap® ChIP简化qPCR分析流程 ——5小时内制备染色质
    Porvair Sciences公司Chromatrap®产品事业部宣布推出固态ChIP试剂盒。此款固态ChIP试剂盒通过一项独有的专利技术简化了实验流程,可迅速提高染色质免疫沉淀(ChIP),确保在5小时内制备染色质用于qPCR分析。
 
   Chromatrap®是一项能够使ChIP反应变得更快速、更简单、更有效的突破性技术。qPCR分析所用的Chromatrap®试剂盒采用革命性的 Chromatrap®蛋白质 A 或蛋白质 G 完成共价连接的圆盘状惰性多孔聚合物捕获目标染色质/抗体复合物,大大提高了捕获效率。反应期间,所述染色质/抗体复合物由盘(disc)保持。只需三个缓冲液和一步洗脱步骤冲洗即能得到目标DNA片段。操作中不需要使用磁珠琼脂糖珠,消除了非特异性背景并大大减少人工操作误差和样品损失。优化的洗脱缓冲液允许样品直接在qPCR中分析,而不需要进行DNA纯化,从而进一步降低样品损失。

    用于qPCR分析的Chromatrap® ChIP试剂盒包含基于蛋白A或蛋白G的离心柱、缓冲液和试剂,足以进行24次染色质免疫共沉淀实验和10次染色质制备。该试剂盒被设计仅用作如qPCR的下游过程,并具有适合低染色质负荷(50ng-7000ng)的宽动态范围。独立测试证明Chromatrap®的DNA pull down水平相比传统方法高出25倍,DNA 富集的信噪比提高到 2 至 3 倍,即使对于只有15,000个细胞每测定的样品亦是如此。
 
 
Porvair推出ChIP-seq测序试剂盒 优势制备纯化染色质
    
     Porvair Sciences 开发了一种新的 ChIP 测序检测试剂盒,利用 Chromatrap® 固态 ChIP 技术优势制备下一代测序库所需的纯化染色质。

    染色质免疫沉淀反应 (ChIP) 是一项用于检测蛋白质和 DNA 之间相互作用的技术,以富集特定蛋白质相关的 DNA 为基础。该技术将 ChIP 与大量同步定序法相结合(ChIP-seq),以准确调查蛋白质与 DAN 之间的相互作用,顺利开展表观遗传学标记研究,从而帮助人们全面了解基因转录调节。蛋白质与 DAN 之间精准又详尽的映射图至关重要,有助于解很多生理流程和疾病状态(包括癌症)背后的调节机制。最近的先进技术发现染色质和转录之间相互作用的动态性和复杂度远远超出人们最初的预测。之前采用微阵列的技术受限于低聚核苷酸探头的数量,因为大量不同物种特定探头对于芯片表面可能过于混乱。下一代测序技术可以同时测定数千万或数亿 DNA 短片段的序列,而且不会造成阵列的混乱。ChIP-seq 法可以精确到每个碱基对的分辨率,减少了伪影,增加了覆盖面,扩大了动态范围,具有过去技术所不具备的显著优势,让几年前只能想象的实验变成了现实。
 


    Chromatrap® 是一种更快、更简单、更有效的 ChIP-seq 测定方式(专利号:GB2482209)。它采与蛋白质 A 或蛋白质 G 完成共价连接的圆盘状惰性多孔聚合物捕获目标染色质/抗体复合物,大大提高了捕获效率。Chromatrap 将固态技术和高通量测序法相结合,从而可以从少量细胞和染色质浓缩物中获取准确的 ChIP-seq 协议。Chromatrap ChIP-seq 特别适用于更高的染色质浓度,现在还将 Chromatrap 的动态范围与下游深度测序的分析主力相结合,从而可以在基因组中识别转录因子结合位点,以及与蛋白质修饰关联的特定 DNA,完全不存在规模和分辨率方面的限制。
 
 
 
 
 
Chromatrap® ChIP用于表观遗传标记 应用笔记可供下载

    Chromatrap® 是Porvair Sciences 推出的新式固相基质染色质免疫沉淀反应 (ChIP) 测定技术,可成功分离出复杂切片材料中的高质量染色质。
 
    Chromatrap® 技术侧重于沉淀出原始子宫内膜间质细胞中的表观遗传标记,研究人员借此从组织切片的 1 百万个细胞中成功分离出了大量的表观遗传标记,并且相对阴性 IgG 和阴性基因位点,选择性地增强了正激活因子基因目标。详细的工作说明阐述了 ChromaTrap ChIP 测定工具包不仅可正向加强特定基因位点的组蛋白调节标记,同时还能够与人体组织相兼容。
 
此次从原始人体组织细胞富集表观遗传标记所用的协议将在应用笔记中详细阐述,需要笔记请发邮件:info@genechain.net.
 
ChromaTrap® 采用与蛋白质 A 结合的固相多孔聚合物来捕获染色质,较磁珠法的效率得以极大提高。过去的琼脂糖珠或磁珠法工艺复杂,涉及分离、移液和再悬浮等操作,相比之下,Chromatrap 离心柱法的优势显得尤为突出。独立实验表明,Chromatrap 法比传统珠式工艺的 DNA Pull Down 水平高出 25 倍,DNA 富集的信噪比尤为显著,要比常见的工艺高出 2 至3 倍,即使每一个免疫沉淀反应的样品小到50ng至3000ng,都能得出十分稳定的结果。
 
 
 

 
 


新型染色质免疫沉淀反应 (ChIP) 测定法简介
 
    Porvair Sciences 发布了一份手册《染色质免疫沉淀反应的更高效、更灵敏、更可靠测定法》(共计8页),向科学家阐述染色质免疫沉淀反应(ChIP) 的背景信息,介绍了Chromatrap®ChIP测定技术以及 Chromatrap® 与传统磁珠式方法的基准比较报告。
 
    Chromatrap® 是 Porvair Sciences 推出的新式固相基质 ChIP 测定法,全球的研究人员用其成功分离出复杂切片材料中的高质量染色质(索要资料请发邮件:info@genechain.net)。
 
ChromaTrap® 采用与蛋白质 A 或 G 结合的固相多孔聚合物来捕获染色质,灵敏度和效率都比磁珠法有显著提高。与过去的琼脂糖珠或磁珠法工艺相比,Chromatrap 离心柱法的优势显得尤为突出,例如大大缩短了协议时间(ChIP 只需不到 5 小时),减少了手动操作步骤,大大减少了样品损失。现有两种规格面市:单离心柱和 96 孔微孔板高通量规格。两种规格均有卓越的 DAN 富集比,样品范围在 50ng-7000ng 之间。